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（一）接收财政专户拨入的款项时，借记本科目，贷记“财政专户存款”科目。
（二）收到支出户的利息时，借记本科目，贷记“利息收入”科目；划拨支出户的利息到财政专户，借记“财政专户存款”科目，贷记本科目。
（三）支付基金支出时，借记“统筹基金支出”、“家庭账户基金支出”科目，贷记本科目。
四、本科目应按开户银行设置“支出户存款日记账”，由出纳人员根据收付款凭证，按照业务的发生顺序逐笔登记，每日终了应结出余额。“支出户存款日记账”应定期与“银行对账单”核对，至少每月核对一次。月份终了，支出户存款账面结余与银行对账单余额之间如有差额，必须逐笔查明原因进行处理，并应按月编制“银行支出户存款余额调节表”，调节相符。
五、本科目期末借方余额，反映支出户存款结余。
1101 暂付款
一、本科目核算新农合基金收支活动中形成的各种暂付款项，如经办机构向定点医疗机构和定点药店的预付款。
二、暂付款的核算内容如下：
（一）经办机构向定点医疗机构和定点药店预付的医药费，借记本科目，贷记“支出户存款”、“财政专户存款”科目。
（二）经办机构定期与定点医疗机构和定点药店结算医药费款项时，根据予以补偿的医药费支出数额，借记“统筹基金支出”、“家庭账户基金支出”科目，按已预付的医药费金额，贷记本科目，按医药费实际支出数额与已预付医药费金额的差额，贷记“支出户存款”、“财政专户存款”等科目。
（三）定点医疗机构和定点药店退回经办机构多付的预付医药费，按资金的原渠道，借记“财政专户存款”、“支出户存款”科目，贷记本科目。
三、本科目应按暂付款种类和对方单位设置明细账。
四、本科目期末借方余额，反映尚未结清的暂付款。
1201 缴存省级风险基金
一、本科目核算风险基金实行省级统一管理的统筹地区，新农合基金缴存省级财政专户的风险基金。
二、缴存省级风险基金的核算内容如下：
（一）风险基金按规定由省级统一管理的，由经办机构本级财政专户缴入省级财政专户时，借记本科目，贷记“财政专户存款”科目。
（二）风险基金由省级财政专户拨回经办机构本级财政专户时，借记“财政专户存款”科目，贷记本科目。
三、本科目期末借方余额，反映缴存省级统一管理的风险基金余额。
2001 暂收款
一、本科目核算新农合基金收支活动中形成的暂收款。
二、经办机构在本年度收到的参合农民缴纳的以后年度个人缴费以及收到的其他属于以后年度的基金收入，通过本科目核算，在本科目下相应设置“预收基金收入”明细科目及相关明细账。
三、暂收款的核算内容如下：
（一）收到属于以后年度的基金收入时，借记“现金”、“财政专户存款”、“收入户存款”等科目，贷记本科目（预收基金收入）。以后年度，将归属于该年度的各预收基金收入转入相关收入科目，借记本科目（预收基金收入），贷记相关收入科目。
（二）收到其他暂收款项时，借记“现金”、“财政专户存款”、“收入户存款”等科目，贷记本科目。偿付或退回款项时，借记本科目，贷记“现金”、“财政专户存款”、“支出户存款”等科目。
因债权人等特殊原因确实无法偿付的暂收款，经财政部门批准后，计入其他收入，借记本科目，贷记“其他收入”科目。
四、本科目应按暂收款的种类和对方单位设置明细账。
五、本科目期末贷方余额，反映尚未偿付的暂收款。
3001 统筹基金
一、本科目核算新农合统筹基金全部收入扣除全部支出后的滚存结余。
二、本科目应当设置“一般统筹基金”、“风险基金”两个明细科目，进行明细核算。
三、统筹基金的核算内容如下：
（一）期末（含月末，下同），按照新农合统筹补偿方案的要求，将各收入科目贷方余额中归属于统筹基金的金额转入本科目，借记相关收入科目，贷记本科目（一般统筹基金）。将“统筹基金支出”科目借方余额转入本科目，借记本科目（一般统筹基金），贷记“统筹基金支出”科目。
（二）按规定提取风险基金的，借记本科目（一般统筹基金），贷记本科目（风险基金）。
（三）当期因弥补基金非正常超支造成的基金临时周转困难等动用了风险基金的，借记本科目（风险基金），贷记本科目（一般统筹基金）。
四、本科目期末贷方余额，反映历年积存的新农合统筹基金结余。
3002 家庭账户基金
一、本科目核算新农合家庭账户基金全部收入扣除全部支出后的滚存结余。
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