（三）专项审计。
基金会开展以下活动的，应当实施专项审计，在活动结束后向登记管理机关报送经注册会计师审计的专项审计报告，并按照登记管理机关的要求向社会公布。
1．符合以下条件之一的重大公益项目：
（1）当年该项目的捐赠收入占基金会当年捐赠总收入的1/5以上且金额超过人民币50万元的；
（2）当年该项目的支出占基金会当年总支出的1/5以上且金额超过人民币50万元的；
（3）持续时间超过3年的。
2．因参与处理自然灾害等突发事件需要开展的募捐活动。
3．登记管理机关要求进行专项审计的其他活动。
二、审计经费来源和支付方式
基金会审计经费由下列一项或多项来源构成：
（一）基金会自行承担。
基金会应当根据《
基金会管理条例》及其他有关要求，自行承担审计费用。
（二）财政资金。
按照基金会管理权限，中央财政和地方财政安排一定的资金，由登记管理机关在以下三种情形下使用：
1．基金会确因资金困难无法承担审计费用的，可以向登记管理机关提出资助申请，登记管理机关视困难程度给予全额或一定比例的资助。相关申请和管理办法由登记管理机关商同级财政部门另行制定。
2．对于内部治理结构完善、财务管理透明、公益项目运作规范、评估等级较高且同时具备公益性捐赠税前扣除资格和非营利组织免税资格的基金会，登记管理机关可以奖励形式全额或部分承担审计费用。
3．登记管理机关为履行监管职责直接委托会计师事务所对基金会进行的审计，审计费用由登记管理机关承担。
登记管理机关应当按照国库集中支付管理制度和合同约定，将审计费用支付给受托会计师事务所。
（三）会计师事务所公益审计。
财政部门和民政部门鼓励会计师事务所为部分确有困难的基金会提供公益审计服务。会计师事务所提供公益审计服务，是履行社会责任的一种重要形式，中国注册会计师协会和地方注册会计师协会在具体开展全国及各省（自治区、直辖市）会计师事务所年度综合评价排名时应当予以考虑。
三、会计师事务所选聘范围和方式
（一）选聘范围。
对在民政部登记的基金会实施审计的会计师事务所，应当进入中国注册会计师协会公布的上一年度全国会计师事务所综合评价前100名；或具备三年以上（含三年）从事基金会或其他非营利组织审计工作经验，且注册会计师人数在15人以上，上一年度审计业务收入在600万元以上。
