（一）关于转移支付在财政支出中占比较高的问题。财政部正在研究加快地方税收体系建设，提高地方财政收入自给能力，形成规范透明的转移支付制度，并进一步完善转移支付分配办法，推进基本公共服务均等化进程。
（二）关于专项转移支付在转移支付中占比较高的问题。财政部将推进专项转移支付项目的清理归并，严格控制新增专项转移支付项目，将部分按因素分配、用于保障和改善民生等基本公共服务领域、数额相对较大的专项转移支付调整为一般性转移支付，并结合财政体制改革进展，研究完善均衡性转移支付等一般性转移支付项目的规模确定机制，逐步提高一般性转移支付规模和比重。
（三）关于部分专项资金设置交叉重复的问题。财政部将继续推进专项转移支付项目的清理整合，对政策目标已经实现、形势发生变化或与公共财政要求不尽符合的，将及时予以清理；对政策目标相近、资金投入方向类同、资金管理方式相近的，将予以归并；探索对涉农资金等做“自下而上”与“自上而下”相结合的统筹整合。
（四）关于上级转移支付资金未完整纳入地方预算的问题。财政部正在研究继续改进转移支付指标提前通知工作，为进一步提高地方预算编制的准确性和完整性创造条件。
四、国税征管审计查出问题的整改情况
（一）关于部分涉税审批事项不合规的问题。对批准企业超过认证期限的增值税发票进项税款予以抵扣问题，经国务院批准，税务总局发布公告，明确了因客观原因逾期的增值税进项税款抵扣相关要求。对违规批准税前扣除和减免税优惠、流失税款25.78亿元问题，税务总局和有关部门进一步明确了有关政策规定，相关国税局积极补征税款及滞纳金，涉及税款24.35亿元。对不符合条件的高新技术企业享受26.65亿元税收优惠问题，科技部、财政部、税务总局等部门完善了高新技术企业认定管理的相关措施，有关国税局正在积极追缴税款及滞纳金，涉及税款26.45亿元。对尚未追缴入库的税款，相关国税局也制定了缴款计划。
（二）关于纳税审核和发票管理不严格的问题。对违规代开发票问题，10个区县级国税局开展了代开发票业务的全面检查，并完善了相关制度，强化了责任追究，对6名责任人员给予党纪政纪处分；通过加强对受票企业的稽查，追缴入库税款534.12万元。对15户企业虚开发票及使用不规范发票问题，相关国税局正在调查处理，已入库税款（含滞纳金和罚款）6283.24万元，个别情节较为严重的虚开、代开发票问题，公安部门正在立案查处。对纳税申报审核不严少征企业所得税问题，相关国税局对涉及的企业进行了专项检查，已征缴入库税款及滞纳金、罚款共计9.84亿元。
（三）关于人为调节税收进度的问题。相关国税局全部整改完毕，并结合整改下发了关于规范延期申报和延期缴纳税款审批、进一步加强税收征收管理等规定。
