（二）有机溶剂废气优先采用冷凝、吸附－冷凝、离子液吸收等工艺进行回收，不能回收的应采用燃烧法等进行处理。
（三）发酵尾气宜采取除臭措施进行处理。
（四）含氯化氢等酸性废气应采用水或碱液吸收处理，含氨等碱性废气应采用水或酸吸收处理。
（五）产生恶臭的生产车间应设置除臭设施；动物房应封闭，设置集中通风、除臭设施。
五、固体废物处置和综合利用
（一）制药工业产生的列入《
国家危险废物名录》的废物，应按危险废物处置，包括：高浓度釜残液、基因工程药物过程中的母液、生产抗生素类药物和生物工程类药物产生的菌丝废渣、报废药品、过期原料、废吸附剂、废催化剂和溶剂、含有或者直接沾染危险废物的废包装材料、废滤芯（膜）等。
（二）生产维生素、氨基酸及其他发酵类药物产生的菌丝废渣经鉴别为危险废物的，按照危险废物处置。
（三）药物生产过程中产生的废活性炭应优先回收再生利用，未回收利用的按照危险废物处置。实验动物尸体应作为危险废物焚烧处置。
（四）中药、提取类药物生产过程中产生的药渣鼓励作有机肥料或燃料利用。
六、生物安全性风险防范
（一）生物工程类制药中接触病毒或活性菌种的生产、研发全过程应灭活、灭菌，优先选择高温灭活技术。
（二）存在生物安全性风险的抗生素制药废水，应进行前处理以破坏抗生素分子结构。
（三）通过高效过滤器控制颗粒物排放，减少生物气溶胶可能带来的风险。
（四）涉及生物安全性风险的固体废物应进行无害化处置。
七、二次污染防治
（一）废水厌氧生化处理过程中产生的沼气，宜回收并脱硫后综合利用，不得直接放散。
（二）废水处理过程中产生的恶臭气体，经收集后采用化学吸收、生物过滤、吸附等方法进行处理。
（三）废水处理过程中产生的剩余污泥，应按照《
国家危险废物名录》和危险废物鉴别标准进行识别或鉴别，非危险废物可综合利用。
（四）有机溶剂废气处理过程中产生的废活性炭等吸附过滤物及载体，应作为危险废物处置。
（五）除尘设施捕集的不可回收利用的药尘，应作为危险废物处置。
八、鼓励研发的新技术
