（一）指导思想：以科学发展观为指导，按照建设资源节约型、环境友好型社会和社会主义新农村的要求，坚持以人为本和城乡统筹，把农村环境保护与改善农村人居环境、促进农业可持续发展、提高农民生活质量和健康水平以及保障农产品质量安全结合起来，切实抓好源头控制、过程管理、废弃物资源化利用，着力推进环境友好型农村生产生活方式的普及，加快农村生态文明和新农村建设步伐，为构建社会主义和谐社会提供基础环境保障。
（二）基本原则
1、统筹协调，突出重点。统筹协调城市和农村环境保护，把农村环境保护放到和城市同等位置，统筹规划农村环保各项工作，优先解决好农村饮水安全、面源污染和自然生态保护等环境问题。
2、因地制宜，分类施策。针对区域内不同村镇的具体情况，分类型采取保护治理对策。
3、典型引路，项目带动。抓住重点，分清主次，针对环境污染状况，确立重点项目，集中资金，优先治理，取得经验，全面推广。
4、科技先行，机制创新。重点推广科技含量高、经济效益好的环保新技术。建立政府、企业、农民多元化投入机制，积极引导社会资金投入农村环境保护领域。
5、环境优先，统筹兼顾。把农村环境保护与农村经济发展、城乡建设结合起来，以发展促保护，以环境求发展，经济、社会、环境效益相统一。
6、政府引导，农民参与。落实各级政府保护农村环境责任，加大财政对农村环保的支持力度，建立激励机制，鼓励和引导农民及社会力量积极参与农村环境保护。
三、总体目标
到2010年，农村环境污染状况得到改变，农村饮用水水源得到保护；生态环境保护、恢复与建设取得较大进展；规模化畜禽养殖污染得到较好控制，工业污染和生活污染防治取得初步成效，农业面源污染防治得到重视，农村改水、改厕工作顺利推进，农村环境健康危害得到有效控制；无公害、绿色、有机食品生产基地进一步扩大；环境优美乡镇、生态村创建全面展开，农村环境监管能力进一步加强，群众环保意识普遍提高。具体指标为：
--测土配方施肥技术覆盖率与高效、低毒、低残留农药使用率提高10%以上；农村畜禽粪便、农作物秸秆的资源化利用率以及生活垃圾和污水的处理率均提高10%以上；农村卫生厕所普及率达到65%以上。
--农村沼气用户达到6万户，太阳能采暖房达到1.7万户，太阳灶达到6.7万台，太阳能热水器达到4万户。
--建成无公害、优质农产品生产基地16.7万h㎡，无公害农产品占到农产品总量的60％以上，农产品抽检合格率达到85%以上。
