市农业局：指导地方开展农村面源污染控制，农业结构调整工作；负责水源区农业建设项目的编制、申报、争取工作；负责生态农业示范区项目的组织实施工作；负责全市农业生态建设项目投入测算及补偿建议；重点做好农业产业化建设、有机农业开发、生物农药及生物肥推广等项目的争取落实工作。

　　市林业局：负责水源区林业建设项目的编报、争取工作；负责全市林业生态建设投入、淹没造成林特收入损失测算及补偿建议；重点抓好退耕还林工程、天然林保护工程、生态公益林建设、库区湿地保护工程、珍稀动植物迁建保护等项目的争取和实施工作。

　　市水利水电局：负责全市水资源保护管理与综合配置；负责水土保持项目的实施及库区水利设施配套、水利和水电项目的编制、申报、争取工作；重点抓好水利工程的恢复重建；指导库区防护工程建设。

　　市商务局：负责南水北调相关项目的对外推介与招商；配合经贸部门做好北京、天津等诚信知名企业、品牌引进与落户库区工作。

　　市文体局：负责市南水北调水源区有形和无形文化遗产保护；牵头抓好地面文物搬迁和地下文物发掘等项目的编报、争取和实施工作；负责南水北调中线工程重大文化活动的组织落实。

　　市卫生局：参与制定丹江口库区库底卫生清理工作技术方案及丹江口库区库底清理工作；配合有关部门做好库底卫生清理效果评估与检查验收工作；负责组织丹江口库区疾病监测及相关流行性疾病综合治理项目的设计、论证、效果评估和检查验收；负责建立高效运转的医疗救治体系，应对区域性南水北调突发性公共卫生应急案件。

　　市环保局：负责争取国家制订符合南水北调水源区实际的水污染防治政策；做好水污染控制和污染源监督工作；负责十堰区域水环境监测能力建设项目的组织实施工作。

　　市旅游局：负责做好丹江口水库旅游项目的规划、编报、争取工作；组织开展旅游推介活动。

　　市扶贫办：负责丹江口库区农村扶贫开发工作；负责研究南水北调工程对全市扶贫工作的影响及补偿政策研究；重点做好库区生态移民及库区扶贫优惠政策的争取工作。

　　市档案局：负责南水北调工程档案的收集、整理、分类、鉴定、编目、统计、保管的指导与管理工作。

　　市广电局：负责组织广播电视各媒体南水北调中线工程的宣传策划及组织实施。

　　市移民局：负责移民安置工作的组织实施；负责争取国家制定符合丹江口库区实际的移民优惠政策；负责淹没搬迁企业、关闭企业对全市造成的影响研究及相关补偿政策建议。

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