各级政府要加强对农村合作（居民基本）医疗保险机构的控制，确保基金安全运作并发挥最大使用效益及效率。重点突出以下八个方面：一是保证基金及时到位，个人部分在上年底之前完成收缴任务，财政、集体部分要与地方税（创）收相同步；二是确保资金安全，杜绝贪污挪用等违规违法现象发生，所有基金支出符合基金管理、补偿办法、财务审计等管理要求；三是基金存入银行的利息增值部分、上级主管部门下拨的专项资金按规定列入相关财务科目；四是基金实行封闭运行。工作人员及管理经费由同级财政保障解决，不得在基金中开支；五是医疗保障费用实行专款专用，公共卫生等服务费用划入农村公共卫生服务专项支出经费；六是不得拖欠病人结报的医药费用，病人领取的手工结报费用必须签字留存；七是所有结报信息要通过文件、报纸、网络、会议、公示栏等渠道定期向社会公示；八是上级主管与审计部门要定期对下级（含同级行政对基金结算中心）实行督查。
五、重视管理，突出区域网络化运作
我市农村合作（居民基本）医疗保险经过五十年的发展，目前已进入全新的发展阶段。当前，在政府高度重视社会民生问题的背景下，我们要抓住机遇：一是高度重视管理工作，建立健全管理机构，对人员配置按照专业知识组合型办法实施，满足“管理、医疗、保险、财务、网络”等具体岗位工作需要；二是同级财政要保障有足够的人员及工作经费；三是所有人员要按照上级规定标准，定期开展知识更新再教育，上级主管部门要加强业务培训；四是实行全员聘用、持证上岗、岗位负责制等；五是充分发挥网络作用，提高办事效率，方便居民服务；六是对现有软件系统，要逐步升级提高，做好与省级管理平台对接准备工作；七是在保障城乡居民“刷卡看病”的同时，要高度重视医疗保障信息的安全与保密，保护个人隐私权，八是要发挥信息的作用。及时收集、整理、使用、归档重要信息，发挥信息对现代管理的正反馈作用，做好网络信息的远程安全备份。
六、做好救助，确保健康权益的公平
医疗救助是一项政府和社会行为，为保护农村弱势群体，维护健康权益的公平性，各地要进一步完善农村特困人群医疗救助制度，确保人人享有基本医疗卫生服务。重点抓好：1.基金标准的确定。原则上达到上年城乡人均医疗保健平均消费水平（苏州市2007年人均550元左右）；2.救助基金来源。主要来源于政府财政和民政、红会等社会募捐资金；3.规范基金运作。对筹资、建账、参保、救助、统计、监管等各环节要进行规范。医疗救助与医疗保险是两个完全不同的概念，医疗救助是实现健康权益公平性的有效举措。因此，既不能以“保”代“救”，也不能以“救”代“保”；4.强化合署办公。医疗救助要与医疗保险有机结合，实行“统分结合，有分有合”，既可以提高工作效率，又可降低政府行政成本。但在政策、制度、服务、管理等方面要更多地向弱势群体和医疗救助倾斜。
